Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGPD3A6NKT7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGPD3A6NKT7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms