Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRCP1A6NGW2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRCP1A6NGW2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
STRCP1A6NGW2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRCP1A6NGW2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
STRCP1A6NGW2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
STRCP1A6NGW2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
STRCP1A6NGW2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STRCP1A6NGW2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.58■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
STRCP1A6NGW2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms