Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L9A6NEM1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms