Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37CA5D8V6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms