Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms