Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYL6

RPL17-C18orf32, Protein RPL17-C18orf32, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms