Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 GPR161-201ENST00000271357 7806 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 NUP107-201ENST00000229179 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 GMDS-AS1-202ENST00000505870 8217 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 SCN9A-203ENST00000409672 9768 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 KLC1-204ENST00000348520 15091 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
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TCOF1Q13428 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 URB1-201ENST00000382751 10832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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TCOF1Q13428 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 ELP4-229ENST00000640961 8164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AC008124.1-201ENST00000609803 9730 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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TCOF1Q13428 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
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TCOF1Q13428 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
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TCOF1Q13428 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
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TCOF1Q13428 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
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