Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
FOXO1Q12778 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms