Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TMPOP42166 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TMPOP42166 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TMPOP42166 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TMPOP42166 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TMPOP42166 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TMPOP42166 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TMPOP42166 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TMPOP42166 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TMPOP42166 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TMPOP42166 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TMPOP42166 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TMPOP42166 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TMPOP42166 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms