Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RAB21-201ENST00000261263 15546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 PCDH19-203ENST00000420881 7936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 OR2A5-202ENST00000641693 8681 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 PLEKHG4B-201ENST00000283426 11515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 STAMBP-201ENST00000339566 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 CR1-206ENST00000400960 6959 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 JAKMIP2-201ENST00000265272 6001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 ENAH-204ENST00000366844 13168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 GABRB3-216ENST00000628124 5581 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 Z99129.3-201ENST00000624363 6430 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 AL121722.1-201ENST00000638550 4849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 LRRC37A9P-201ENST00000603850 5376 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 PTPRT-206ENST00000373198 12746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRMP28827 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
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