Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 LINC01105-203ENST00000431188 3329 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 ARMCX3-207ENST00000537169 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 APOBEC4-201ENST00000308641 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 LINC00501-201ENST00000425388 2046 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 PPP2R2B-202ENST00000394409 10704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 IGSF11-201ENST00000354673 3206 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
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PTPRAP18433 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AL353626.1-201ENST00000613429 507 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC087501.5-201ENST00000607496 2374 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 LINC01588-202ENST00000528300 3208 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 MID1-212ENST00000616003 1926 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AGXT2-206ENST00000618015 2181 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 MCF2L2-203ENST00000447025 2394 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 ZNF812P-202ENST00000536819 1890 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 ABLIM3-201ENST00000309868 4326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 ADH7-201ENST00000209665 2289 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 MUM1L1-201ENST00000337685 4308 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPRAP18433 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
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