Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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LINC00587B1AMM8 CT45A8-202ENST00000611660 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 CT45A10-201ENST00000611668 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 CT45A2-202ENST00000612907 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 IL13-206ENST00000617259 498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 CCNT1-206ENST00000640148 596 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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