Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPF2

CHST11, Carbohydrate sulfotransferase 11, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST11Q9NPF2 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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CHST11Q9NPF2 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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CHST11Q9NPF2 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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CHST11Q9NPF2 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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CHST11Q9NPF2 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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CHST11Q9NPF2 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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CHST11Q9NPF2 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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CHST11Q9NPF2 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHST11Q9NPF2 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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