Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AL022068.1-201ENST00000636202 1875 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 MAPK10-371ENST00000641952 5209 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 CHN2-208ENST00000412711 2991 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 MAPK10-241ENST00000639234 2985 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 HIST1H2BN-203ENST00000606613 4137 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 RNF24-203ENST00000432261 3149 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 ADGRE1-201ENST00000250572 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 ATP1A4-201ENST00000368081 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 NSA2-205ENST00000610426 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 SPA17-204ENST00000532692 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 ZNF189-202ENST00000339664 3021 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 TDP1-201ENST00000335725 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 MYO1B-201ENST00000304164 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 ABCB4-202ENST00000358400 3826 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AL137058.2-203ENST00000398039 825 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 SMIM2-201ENST00000400419 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
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FOXQ1Q9C009 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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FOXQ1Q9C009 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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FOXQ1Q9C009 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 SAMMSON-222ENST00000641901 2727 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 ZADH2-202ENST00000537114 3205 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 NDUFS1-204ENST00000440274 2394 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 AL358913.2-201ENST00000553881 1548 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 FTO-222ENST00000637969 2889 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 A1CF-201ENST00000282641 9350 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 LINC02209-201ENST00000521245 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 RABEP1-201ENST00000341923 2490 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
FOXQ1Q9C009 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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