Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 LINC01151-201ENST00000521608 571 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms