Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CTXN3Q4LDR2 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms