Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC8.79□□□□□ -1
TCOF1Q13428 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC8.79□□□□□ -1
TCOF1Q13428 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
TCOF1Q13428 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC8.79□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
TCOF1Q13428 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC8.79□□□□□ -1
TCOF1Q13428 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
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TCOF1Q13428 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
TCOF1Q13428 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
TCOF1Q13428 TMED8-201ENST00000216468 7784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
TCOF1Q13428 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
TCOF1Q13428 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
TCOF1Q13428 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC8.79□□□□□ -1
TCOF1Q13428 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
TCOF1Q13428 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
TCOF1Q13428 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
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TCOF1Q13428 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.78□□□□□ -1
TCOF1Q13428 APELA-202ENST00000507152 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
TCOF1Q13428 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC8.78□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC8.78□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
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TCOF1Q13428 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
TCOF1Q13428 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC8.78□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC8.78□□□□□ -1
TCOF1Q13428 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC8.78□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC8.78□□□□□ -1
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TCOF1Q13428 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
TCOF1Q13428 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
TCOF1Q13428 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
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TCOF1Q13428 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
TCOF1Q13428 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
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TCOF1Q13428 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
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TCOF1Q13428 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
TCOF1Q13428 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
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