Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 RBFOX1-223ENST00000620507 4018 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 CS-202ENST00000542324 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 AL353583.1-201ENST00000624195 1855 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 ITIH4-201ENST00000266041 3336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 LINC00933-201ENST00000557887 2606 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 CTNNA2-217ENST00000540488 2792 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 SLFN13-210ENST00000534689 3058 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 FGFR1-209ENST00000397113 3680 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 ZC3H7A-201ENST00000355758 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 PPP2R1B-201ENST00000311129 2082 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 TDP1-203ENST00000393454 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 TDRD3-202ENST00000377881 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 HPS5-201ENST00000349215 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 FHAD1-206ENST00000375998 4355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 SCRN3-201ENST00000272732 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 OSBPL3-202ENST00000396429 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 LINC01139-201ENST00000400946 1537 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 SCNN1G-201ENST00000300061 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 AC025283.2-203ENST00000618352 2905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 TCF4-205ENST00000537578 2767 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 PDCD6IP-201ENST00000307296 6161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 MAPK10-313ENST00000641405 2469 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 AC113189.6-201ENST00000636696 3591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 ARFIP1-205ENST00000451320 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 NHLRC2-201ENST00000369301 11051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 NLGN4X-208ENST00000538097 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 TPP2-202ENST00000376065 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 WDR11-201ENST00000263461 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 GABRA1-203ENST00000428797 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 LINC01484-203ENST00000521128 2361 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 AC020549.1-201ENST00000536916 1440 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
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FOXC1Q12948 MTF2-201ENST00000370298 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 SELENOP-203ENST00000506577 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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FOXC1Q12948 AC012506.4-202ENST00000430051 572 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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FOXC1Q12948 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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FOXC1Q12948 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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FOXC1Q12948 AC005884.1-201ENST00000588604 429 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 OR7E94P-202ENST00000601375 790 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 AC024085.1-201ENST00000604299 432 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 AC023513.1-201ENST00000604396 691 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 AC106782.6-201ENST00000611264 512 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 FLJ36000-201ENST00000612344 3801 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 CASC19-212ENST00000641153 1287 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 LIN9-205ENST00000481685 1916 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 AC008543.1-201ENST00000344893 3383 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 UTRN-203ENST00000367526 3220 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 MAP3K19-202ENST00000375844 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
FOXC1Q12948 DCAF8L2-202ENST00000451261 2295 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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