Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC079921.2-201ENST00000507579 455 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 CAST-228ENST00000509903 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 RECQL-204ENST00000444129 3702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 CTNND1-220ENST00000529526 6099 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 COX10-AS1-201ENST00000423323 3000 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 CD101-202ENST00000369470 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 ZNF658-206ENST00000621410 4025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 TTC3P1-201ENST00000399586 6081 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 MAPK10-392ENST00000642103 3126 ntAPPRIS P2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 CLDN12-201ENST00000287916 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC135012.3-201ENST00000599841 4039 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 POU2F3-201ENST00000260264 2903 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC008676.2-202ENST00000509655 1992 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 PLCG2-201ENST00000359376 3819 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC022509.1-203ENST00000541940 708 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC010605.1-201ENST00000597303 797 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
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