Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC011824.1-201ENST00000584863 561 ntTSL 4 BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 ZNF431-206ENST00000599296 586 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC007731.1-202ENST00000610338 1870 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC104073.4-201ENST00000632111 598 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC017000.1-201ENST00000639380 578 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 FOLH1B-202ENST00000529567 2145 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC113608.1-201ENST00000398740 305 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 SNX18P13-201ENST00000412442 529 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 CLIC4P3-201ENST00000422221 752 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 SNX18P14-201ENST00000429308 574 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL357314.1-201ENST00000433521 806 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 ATP5LP4-201ENST00000434169 307 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 LINC01105-205ENST00000450794 580 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 LINC01364-201ENST00000452509 889 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC026979.2-201ENST00000523733 583 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC084880.4-201ENST00000538405 577 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 EGLN3P1-201ENST00000541727 720 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RNASE11-206ENST00000553849 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL118558.1-201ENST00000557551 566 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RN7SL835P-201ENST00000579920 262 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC130324.2-201ENST00000580873 638 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RN7SL697P-201ENST00000582484 299 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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UBXN4Q92575 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 SAMMSON-203ENST00000641005 2168 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 LINC02511-201ENST00000505736 1668 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 KYNUP1-201ENST00000466683 1406 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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