Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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