Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 LINC01176-202ENST00000628121 716 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 ENSA-215ENST00000638926 360 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 RNF141-201ENST00000265981 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 A1CF-201ENST00000282641 9350 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 NIPBL-202ENST00000448238 8729 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 CCNB2-205ENST00000621385 2503 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 SDK2-201ENST00000392650 10723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 AFAP1-AS1-201ENST00000608442 6795 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 ZNF185-202ENST00000318529 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 KIF6-208ENST00000538893 2386 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 ATXN1-202ENST00000436367 10587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 ALOX12P2-210ENST00000574727 4326 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 CLDN2-203ENST00000541806 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 WDR11-201ENST00000263461 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 EGF-206ENST00000509793 4489 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 AL512604.2-201ENST00000426946 1314 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 SLC39A9-202ENST00000336643 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 ZNF322-208ENST00000622479 4882 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 PRLR-213ENST00000514088 1440 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 SH3GLB1-205ENST00000616170 6456 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 PCDH15-223ENST00000495484 1896 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 NLRP3-203ENST00000366496 3996 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 KCTD16-202ENST00000512467 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 OR4D9-201ENST00000329328 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 LY6G6D-223ENST00000375825 402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 RPSAP8-201ENST00000429844 889 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 LINC01422-202ENST00000438113 517 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 AC239367.1-201ENST00000439389 936 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 BX293535.1-201ENST00000443579 283 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 AC016489.1-201ENST00000461109 375 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 LEF1-AS1-205ENST00000508286 444 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 AF186996.2-201ENST00000508347 907 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 AC104123.1-202ENST00000511775 581 ntTSL 4 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 AP003064.1-201ENST00000526045 590 ntTSL 4 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 MIR4258-201ENST00000580920 91 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 AC005537.1-202ENST00000585996 666 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 AC008392.1-201ENST00000600941 437 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 uc_338.2-201ENST00000612963 182 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 LINC01206-228ENST00000628718 871 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 AC068205.4-201ENST00000637880 804 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 LINC01060-204ENST00000510832 2435 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 ZNF608-203ENST00000504926 4726 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 QTRT2-201ENST00000281273 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 SCG3-201ENST00000220478 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 KIF13A-204ENST00000378826 5747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 AL031118.1-201ENST00000607727 2955 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 DCTN4-203ENST00000447998 4208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 ERMARD-205ENST00000418781 1841 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 LRRC2-202ENST00000395905 5100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 PPFIA2-220ENST00000550584 5405 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 TNPO3-202ENST00000471166 3019 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 IFIT2-202ENST00000611722 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 PHLDB2-207ENST00000477695 5813 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 FMN1-203ENST00000558197 4060 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 MORF4L2-203ENST00000422154 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 SEZ6-204ENST00000442608 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 MCC-209ENST00000515367 3844 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 AL354993.1-201ENST00000436286 3280 ntTSL 4 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 ZBTB43-201ENST00000373457 5695 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 ATP7B-206ENST00000448424 6404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 GOSR2-238ENST00000640495 3395 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CAMK2BQ13554 AL132655.3-201ENST00000603095 1619 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms