Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
TCOF1Q13428 FREM1-204ENST00000422223 10086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 ABCA1-202ENST00000374736 10494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
TCOF1Q13428 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
TCOF1Q13428 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
TCOF1Q13428 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
TCOF1Q13428 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
TCOF1Q13428 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
TCOF1Q13428 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
TCOF1Q13428 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
TCOF1Q13428 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
TCOF1Q13428 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC8.79□□□□□ -1
TCOF1Q13428 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
TCOF1Q13428 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC8.79□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
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