Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC023818.2-201ENST00000623817 2304 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 KCNMA1-203ENST00000354353 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 SCG3-201ENST00000220478 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 TOM1L1-220ENST00000575333 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 CTAGE15-201ENST00000420911 2587 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 CD200R1-202ENST00000308611 2299 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ZSWIM5P3-201ENST00000511265 2743 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 CACNB4-270ENST00000638040 2026 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ERC1-203ENST00000360905 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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