Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AP4S1-211ENST00000616371 4595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 GLI1-201ENST00000228682 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 IKZF3-207ENST00000377944 1669 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 IKZF3-208ENST00000377945 1696 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 SCN9A-203ENST00000409672 9768 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC117382.2-201ENST00000564748 3151 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
PTPREP23469 KIF4B-201ENST00000435029 4378 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC007126.1-201ENST00000508202 4781 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
PTPREP23469 KRT23-202ENST00000436344 1485 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PTPREP23469 ARHGAP1-201ENST00000311956 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PTPREP23469 GTF3C3-201ENST00000263956 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PTPREP23469 MSH5-205ENST00000395853 2704 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PTPREP23469 CTD-2201I18.1-202ENST00000514042 2705 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PTPREP23469 TMEM45A-201ENST00000323523 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PTPREP23469 PIWIL4-201ENST00000299001 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PTPREP23469 TMPRSS11D-201ENST00000283916 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PTPREP23469 EYA4-213ENST00000531901 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PTPREP23469 ABLIM3-202ENST00000326685 4164 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
PTPREP23469 PBRM1-206ENST00000409114 5015 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
PTPREP23469 NF1P2-201ENST00000556855 2505 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 MAPK10-319ENST00000641459 2542 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 COL21A1-212ENST00000535941 3369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 PVALB-201ENST00000216200 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 CASP8-208ENST00000392266 1283 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 PKMP3-201ENST00000405497 715 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AL773545.3-201ENST00000414297 706 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AC011747.1-201ENST00000425678 565 ntTSL 4 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AC000362.1-201ENST00000433725 425 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 ZNF462-204ENST00000441147 4691 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AC108688.1-201ENST00000485817 713 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AC091982.1-201ENST00000518134 520 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AP001994.1-201ENST00000527539 826 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 RN7SL697P-201ENST00000582484 299 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AP003068.4-201ENST00000623192 802 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 SLC8A1-AS1-228ENST00000627210 225 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 ZNF878-201ENST00000547628 1734 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 EYA4-203ENST00000367895 5699 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 NLRP9P1-201ENST00000540920 2655 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AC114324.1-201ENST00000504077 3152 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 LHFPL3-AS2-202ENST00000631061 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 MARK2P10-201ENST00000454959 1437 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 CORIN-205ENST00000504584 2417 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 LRRC8B-206ENST00000640258 8034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PTPREP23469 WBP1L-201ENST00000369889 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPREP23469 NAA40-202ENST00000377793 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPREP23469 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPREP23469 GLS2-215ENST00000539272 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPREP23469 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPREP23469 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPREP23469 AC015813.3-201ENST00000584805 6113 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPREP23469 A1CF-201ENST00000282641 9350 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPREP23469 PTPRD-204ENST00000397606 5038 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPREP23469 PTPRD-211ENST00000486161 5039 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPREP23469 BCLAF1-223ENST00000628517 2512 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPREP23469 MBD3L1-201ENST00000305625 748 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPREP23469 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPREP23469 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPREP23469 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPREP23469 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PTPREP23469 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 324.9 ms