Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 TFCP2L1-201ENST00000263707 9292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TRHP20396 ZMYM2-202ENST00000382871 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TRHP20396 MAB21L3-201ENST00000369500 3229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TRHP20396 TARS2P1-201ENST00000506124 2041 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
TRHP20396 FAM47C-201ENST00000358047 3270 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 CEP95-201ENST00000553412 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 ADIPOQ-202ENST00000444204 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 OFCC1-201ENST00000316020 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 TRBV9-201ENST00000390363 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 AC064875.1-203ENST00000422996 582 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 HCAR3-201ENST00000528880 2137 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 OFCC1-217ENST00000611763 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 CALCOCO1-210ENST00000548263 3888 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 AP3B2-209ENST00000542200 3921 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 MED21-201ENST00000282892 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 MAP6-204ENST00000526740 1755 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 CCDC150P1-201ENST00000537123 2215 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 LHFPL3-AS2-202ENST00000631061 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 NCOA4-201ENST00000578454 2307 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 MOSPD1-203ENST00000370783 2364 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 AL031595.3-201ENST00000624919 14262 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 ATP7B-205ENST00000418097 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 IFT122-205ENST00000431818 4414 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 MTR-202ENST00000366577 10529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 HNRNPA1L2-201ENST00000357495 3011 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 MEGF10-203ENST00000503335 7571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRHP20396 CDRT1-204ENST00000395906 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 KNG1-201ENST00000265023 3435 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 USP6-205ENST00000574788 8464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 SGK1-203ENST00000367857 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 GOSR2-240ENST00000640621 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 YY1AP1-203ENST00000347088 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 DNM1P46-201ENST00000341853 3831 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 SNORA73B-201ENST00000363217 204 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 CAPNS1P1-201ENST00000401029 633 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 AL773572.1-202ENST00000440221 1004 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 AC009411.2-201ENST00000458359 539 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 RN7SL861P-201ENST00000473793 285 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 AC015722.1-201ENST00000557499 385 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 LSM3P5-201ENST00000566307 306 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 RPS7P1-201ENST00000571702 585 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 AC020908.2-201ENST00000595134 405 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 IGKV1OR1-1-201ENST00000613775 347 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 ACACA-232ENST00000614438 569 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 DNTT-202ENST00000630152 1954 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 MEIS2-202ENST00000338564 4829 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 MEIS2-222ENST00000561208 4822 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 GGA2-201ENST00000309859 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 MORN3-201ENST00000355329 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 ZEB2-236ENST00000636471 9583 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 GREB1L-201ENST00000269218 5600 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 WIPF3-203ENST00000409290 4002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 CX3CR1-206ENST00000542107 3215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRHP20396 CD3EAP-201ENST00000309424 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms