Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 ZNF90-201ENST00000418063 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 NF1P8-201ENST00000415351 1461 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 LINC01692-201ENST00000441009 2719 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 CCDC77-210ENST00000540180 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 SAMMSON-203ENST00000641005 2168 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 HDAC1P1-201ENST00000455482 1445 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 ZCWPW2-201ENST00000383768 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 SAP18-207ENST00000607003 2234 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
NFKB1P19838 TP63-207ENST00000418709 2810 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 ESRRG-222ENST00000493748 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC242022.1-201ENST00000638002 1565 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 CSN2-201ENST00000353151 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 RN7SKP36-201ENST00000363997 312 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 ST3GAL3-213ENST00000372365 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 GRM7-AS2-201ENST00000427748 520 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 ECHDC1-207ENST00000430841 1009 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC018980.1-201ENST00000457848 862 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 RN7SL213P-201ENST00000463482 317 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 LINC00518-202ENST00000479822 906 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC006487.2-201ENST00000503624 577 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC079921.2-201ENST00000507579 455 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 OR7E83P-201ENST00000511021 970 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 OR6M3P-201ENST00000531567 700 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC021755.3-201ENST00000560376 864 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC118757.1-202ENST00000589074 609 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AP001120.4-201ENST00000590231 108 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 OR7E94P-202ENST00000601375 790 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AL136985.2-201ENST00000607372 535 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 Metazoa_SRP.189-201ENST00000614219 303 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC243830.2-201ENST00000618067 630 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 OR4Q3-202ENST00000642117 2165 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 KDM4C-205ENST00000428870 3039 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 PSG6-201ENST00000187910 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.5 ms