Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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