Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 NBPF12-202ENST00000579935 5035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 USF3-201ENST00000316407 13708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 AFAP1-AS1-201ENST00000608442 6795 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 ACO1-201ENST00000309951 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 SORBS1-211ENST00000371247 7354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
COL24A1Q17RW2 PLEKHG4B-201ENST00000283426 11515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 PCDH19-201ENST00000255531 7937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 MKI67-202ENST00000368654 12678 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC068535.1-201ENST00000416008 471 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 PDPR-210ENST00000568530 7223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AL512590.3-202ENST00000534123 6463 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 MAVS-201ENST00000416600 11596 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 DST-206ENST00000370788 17657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 ZNF462-204ENST00000441147 4691 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 FSD2-201ENST00000334574 6418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 DRP2-202ENST00000395209 7277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 MGAT5-201ENST00000281923 8144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
COL24A1Q17RW2 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms