Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AP001803.1-201ENST00000525668 147 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 FAM30C-201ENST00000561158 410 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC026108.1-201ENST00000635444 547 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 DEFB4A-201ENST00000302247 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 CNTRL-202ENST00000373844 713 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 LINC00271-203ENST00000438618 1202 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL022157.1-201ENST00000439622 665 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RPSAP48-201ENST00000466509 889 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC103855.4-201ENST00000533158 265 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 PDCL3P1-201ENST00000534575 734 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AP001122.1-201ENST00000572256 541 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC096708.2-201ENST00000577676 512 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms