Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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CDH18Q13634 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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CDH18Q13634 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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