Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 SYNE3-205ENST00000557275 13488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
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TCOF1Q13428 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 VANGL1-204ENST00000369510 8647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
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TCOF1Q13428 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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TCOF1Q13428 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
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TCOF1Q13428 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
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TCOF1Q13428 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
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TCOF1Q13428 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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TCOF1Q13428 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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TCOF1Q13428 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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TCOF1Q13428 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
TCOF1Q13428 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
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