Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
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IFT88Q13099 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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IFT88Q13099 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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IFT88Q13099 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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IFT88Q13099 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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IFT88Q13099 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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IFT88Q13099 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC007204.1-201ENST00000621794 555 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
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