Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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GPS1Q13098 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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GPS1Q13098 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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GPS1Q13098 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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GPS1Q13098 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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GPS1Q13098 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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