Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
CDKN3Q16667 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CDKN3Q16667 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 365.1 ms