Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NTRK2Q16620 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms