Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RN7SL160P-201ENST00000468558 284 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 ATP5J2P4-201ENST00000538774 267 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 SNHG14-217ENST00000552781 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 FRG2IP-201ENST00000563581 781 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC006116.6-201ENST00000593258 1103 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RN7SL778P-201ENST00000607160 297 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LINC02447-201ENST00000499242 1500 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RNGTT-203ENST00000538899 1374 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 IFNA16-201ENST00000380216 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC245047.1-201ENST00000433276 873 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 GLYCTK-AS1-203ENST00000493616 445 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 OR7E163P-201ENST00000505943 894 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 PGAM4P2-201ENST00000512491 721 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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