Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ALCAMQ13740 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms