Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MIR3150A-201ENST00000636546 80 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 FANCB-201ENST00000324138 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 EYA3-201ENST00000373863 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 SOSTDC1-201ENST00000307068 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 PIBF1-201ENST00000326291 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 YES1-205ENST00000584307 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 DNAJC6-202ENST00000371069 5365 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 CU634019.3-201ENST00000623962 2456 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 FP236315.2-201ENST00000624506 2456 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 FP671120.2-201ENST00000624806 2456 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AC007614.6-201ENST00000623729 2620 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 ABI1-205ENST00000376139 3516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 STARD4-212ENST00000512160 3500 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 LINC02452-201ENST00000637833 2982 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 ASH1L-201ENST00000368346 11942 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AL358473.1-202ENST00000458003 3496 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 PPP4R1L-202ENST00000334187 2746 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 PSG5-205ENST00000404580 2145 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 HCAR3-201ENST00000528880 2137 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 GTF2H2B-204ENST00000513202 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 TRIM16-211ENST00000577886 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 NEDD4L-203ENST00000357895 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 PTGS1-203ENST00000373698 4987 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 ERBB3-203ENST00000415288 4353 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 C5orf22-201ENST00000325366 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 ZMYND8-204ENST00000355972 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 UVSSA-201ENST00000324803 4441 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 SLC7A3-201ENST00000298085 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 PCYT1A-201ENST00000292823 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 RABL2A-201ENST00000376439 623 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AC012594.1-235ENST00000424391 727 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AF274573.1-201ENST00000430535 494 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AL589990.1-201ENST00000432210 592 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AC136896.1-201ENST00000438334 547 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 PRB4-202ENST00000445719 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 RN7SL305P-201ENST00000464862 281 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 PHYKPL-205ENST00000476170 824 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 LINC00967-202ENST00000517725 259 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AC011726.3-201ENST00000518031 568 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AC120036.4-201ENST00000521874 256 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AC120042.1-201ENST00000524309 550 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 LMO3-222ENST00000540445 906 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AC112694.1-201ENST00000541939 570 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 LINC00929-205ENST00000557672 514 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AC018521.4-201ENST00000578239 531 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 TMEM55A-206ENST00000630164 171 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 GOSR2-222ENST00000639031 885 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 PAK5-202ENST00000378423 4613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 CMSS1-201ENST00000421999 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 MDH1B-205ENST00000454776 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 DSG1-201ENST00000257192 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 GJB2-202ENST00000382848 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 TDG-202ENST00000392872 3251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 PHF11-201ENST00000357596 1471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 ARHGAP32-206ENST00000527272 5289 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 ASNSD1-201ENST00000260952 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 ZNF217-201ENST00000302342 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 RGS6-219ENST00000622468 5453 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 COL6A4P1-201ENST00000446690 2336 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 ZNF610-203ENST00000403906 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 AC090241.3-201ENST00000621730 2599 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 KBTBD4-204ENST00000526005 2444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 ANGPT2-203ENST00000523120 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 CLCN3P1-202ENST00000609203 1944 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
MKRN4PQ13434 MAPK1IP1L-205ENST00000622254 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 CENPL-203ENST00000367710 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 TBCA-201ENST00000306388 2301 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 SCYL3-203ENST00000367772 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 S100A13-201ENST00000339556 514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms