Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 AL358942.1-201ENST00000418595 1178 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC008770.1-202ENST00000495324 516 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 PPP1R12B-218ENST00000634903 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC022784.6-204ENST00000520390 3442 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 ZMAT4-201ENST00000297737 2466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 MCTP2-203ENST00000451018 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 MIR3142HG-201ENST00000517927 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 CYP4A22-203ENST00000371891 2535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TRHP20396 UGT2B25P-201ENST00000511504 1586 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 GPR19-203ENST00000540510 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 ACSL1-211ENST00000515030 3948 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 ZNF750-201ENST00000269394 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 RHPN2-201ENST00000254260 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 SNX20-201ENST00000300590 3304 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 STRADA-226ENST00000638276 1865 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 HSD11B1-203ENST00000367028 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 COPB2-201ENST00000333188 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 RNA5SP209-201ENST00000411237 97 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC108868.2-201ENST00000451464 511 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 PRICKLE2-AS2-201ENST00000484703 496 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 AP003555.2-201ENST00000528507 655 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC023813.3-201ENST00000561876 539 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 PFKM-225ENST00000551804 2797 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 PPP6R3-218ENST00000529710 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 MRPS11-201ENST00000325844 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 ZNF37A-201ENST00000351773 7027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 PUS3-201ENST00000227474 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 PPP2R1B-201ENST00000311129 2082 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 ARMCX5-206ENST00000604957 4640 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 TRIM52-205ENST00000611618 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TRHP20396 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRHP20396 ZNF135-204ENST00000506786 3349 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRHP20396 ZIM3-201ENST00000269834 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRHP20396 TESK2-201ENST00000372084 2600 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRHP20396 ATP13A4-201ENST00000295548 2157 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRHP20396 MYOM1-202ENST00000356443 5847 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRHP20396 APOL2-201ENST00000249066 2685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRHP20396 GLYAT-202ENST00000344743 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRHP20396 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRHP20396 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TRHP20396 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TRHP20396 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TRHP20396 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRHP20396 CLEC1B-202ENST00000348658 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRHP20396 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TRHP20396 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRHP20396 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TRHP20396 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TRHP20396 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TRHP20396 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRHP20396 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TRHP20396 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TRHP20396 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TRHP20396 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TRHP20396 AC005099.1-201ENST00000442083 610 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms