Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
ERVV-1B6SEH8 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms