Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 EYA3-203ENST00000373871 6085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 LRRC28-201ENST00000301981 5971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 NCAM2-202ENST00000400546 8135 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 CAND1-208ENST00000545606 11251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 RRP8-201ENST00000254605 6560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 RIPOR2-208ENST00000613507 5539 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 PRLR-208ENST00000509140 1610 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
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LRRIQ1Q96JM4 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
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LRRIQ1Q96JM4 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 MEGF10-203ENST00000503335 7571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AC060780.1-202ENST00000590740 5084 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 OR2A5-202ENST00000641693 8681 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 ACACB-203ENST00000377854 6588 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
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LRRIQ1Q96JM4 FAM168A-201ENST00000064778 7296 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
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LRRIQ1Q96JM4 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
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LRRIQ1Q96JM4 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
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LRRIQ1Q96JM4 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 ZNF778-207ENST00000620195 11031 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
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LRRIQ1Q96JM4 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
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LRRIQ1Q96JM4 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
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LRRIQ1Q96JM4 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
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