Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 NCALD-203ENST00000395923 3808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 SLC7A8-206ENST00000469263 3557 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 TMC1-202ENST00000340019 3068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 IGLV3-32-201ENST00000390303 383 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 NRIR-202ENST00000414795 506 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 RPL34P19-201ENST00000415903 342 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 RPS6KA2-IT1-201ENST00000416770 579 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 AC097468.2-201ENST00000429343 553 ntTSL 4 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 OR7H1P-201ENST00000448965 922 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 FAM74A1-201ENST00000465257 623 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 SSU72P8-201ENST00000473520 585 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL259P-201ENST00000478499 253 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 AC107956.2-201ENST00000496042 454 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 LINC01094-206ENST00000514130 594 ntTSL 4 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 LINC01608-202ENST00000524283 561 ntTSL 4 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 FLJ21408-204ENST00000566854 601 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 MIR4685-201ENST00000578185 69 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 AC011933.4-201ENST00000585081 403 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 PFN1P2-202ENST00000621347 397 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 ENO1P4-201ENST00000416471 1785 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 THAP12P1-201ENST00000398672 2203 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 TLR3-202ENST00000504367 2310 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 CCL16-205ENST00000611905 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 DHX35-201ENST00000252011 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 PAH-201ENST00000307000 2466 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 LINC02535-201ENST00000455071 2513 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 AC068389.3-201ENST00000373384 529 ntTSL 4 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP185-201ENST00000390963 114 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 NHP2P2-201ENST00000396362 460 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 MSRB1P1-201ENST00000396851 354 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 PGAM1P3-201ENST00000420790 565 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 AC126124.1-201ENST00000426104 185 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 FGF12-206ENST00000450716 768 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 RPL7P17-201ENST00000470927 724 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL416P-201ENST00000494042 298 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
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