Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 GSTM2-207ENST00000460717 1449 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
GTF2H3Q13889 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms