Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms