Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 ZNF213-AS1-208ENST00000575139 530 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 TTR-205ENST00000613781 556 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AP003108.5-201ENST00000623008 895 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 PRAMEF8-201ENST00000357367 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 OIT3-201ENST00000334011 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 KLHL14-202ENST00000359358 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 MROH7-206ENST00000421030 4329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 ZEB2-215ENST00000465070 2949 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 ZNF714-210ENST00000620627 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 STAU1-205ENST00000371802 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 DEF8-201ENST00000268676 3725 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 WFS1-201ENST00000226760 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 SLFN5-202ENST00000542451 2540 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 GTF3C1-201ENST00000356183 7018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 ERCC3-201ENST00000285398 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 EPPK1-201ENST00000568225 15530 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC010547.5-201ENST00000561908 3677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LINC00672-201ENST00000583195 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 SPATA13-202ENST00000382095 6665 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 COL17A1-203ENST00000393211 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 TTI2-202ENST00000431156 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 ELMO2-204ENST00000396391 3574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 FAM47A-201ENST00000346193 2556 ntAPPRIS P2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 PKNOX1-201ENST00000291547 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RPL12P38-202ENST00000588627 2319 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 BBS9-201ENST00000242067 4027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CTTNBP2-201ENST00000160373 5970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LINC00885-201ENST00000457079 1828 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 IFT46-207ENST00000530872 1566 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 KDM4A-201ENST00000372396 4474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LINC00969-212ENST00000445430 4208 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 UGDH-AS1-201ENST00000504032 2787 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 SVIL-201ENST00000355867 7586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AP002409.1-201ENST00000584722 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 POTEG-202ENST00000547848 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 USP53-201ENST00000274030 5936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 A2ML1-AS2-201ENST00000394240 386 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RPL5P31-201ENST00000399168 635 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 HMGN1P34-201ENST00000413023 290 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RPL4P5-201ENST00000413888 1276 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC006509.2-201ENST00000419124 395 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AL645936.2-201ENST00000430565 928 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC108488.1-205ENST00000438482 914 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CDKN2AIPNLP1-201ENST00000460287 302 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC008897.2-201ENST00000501886 527 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 IGHV3-75-201ENST00000523951 358 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC114689.2-201ENST00000584299 1297 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AL139093.1-201ENST00000622029 1014 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RIPOR2-202ENST00000378023 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 TTC27-201ENST00000317907 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 EFCAB6-201ENST00000262726 4869 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 KCND2-201ENST00000331113 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 RBFOX1-201ENST00000311745 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AL359736.1-201ENST00000382141 4157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 AC090241.3-201ENST00000621730 2599 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 ZNF461-213ENST00000614133 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 MIR3142HG-201ENST00000517927 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
HOXD11P31277 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 PTK2B-203ENST00000397501 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CACNB2-205ENST00000377319 3116 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC092017.4-202ENST00000638931 2006 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ARMCX3-201ENST00000341189 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 C5orf56-201ENST00000337752 4767 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 MMP19-201ENST00000322569 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 UPRT-202ENST00000373379 2234 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 SPECC1L-201ENST00000314328 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ADH4-201ENST00000265512 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ZNF215-201ENST00000278319 3448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 GAD1-202ENST00000358196 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 TBPL1-201ENST00000237264 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 PTGR2-201ENST00000267568 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ESR2-208ENST00000554572 3588 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC079779.1-201ENST00000437798 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 NRAV-201ENST00000500741 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 C16orf62-205ENST00000513947 2501 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 NOP2-203ENST00000399466 2701 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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