Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 NPR3-202ENST00000326958 6380 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SLC8A1-204ENST00000405269 2965 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 PBRM1-205ENST00000409057 4980 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 POT1-201ENST00000357628 4080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 NPL-201ENST00000258317 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SPATA31D1-201ENST00000344803 4833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 MTHFR-203ENST00000376585 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ADGRE2-201ENST00000315576 6767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 PECAM1-203ENST00000563924 6831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ACAN-206ENST00000559004 7628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 RTL10-203ENST00000407472 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 GRIN2A-205ENST00000535259 4118 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SPATA13-202ENST00000382095 6665 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 FAM13A-202ENST00000395002 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 LTBP1-201ENST00000402934 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AL138756.1-201ENST00000563434 4488 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 TULP4-201ENST00000367094 5170 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SOX5-202ENST00000381381 3991 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 LINC02210-213ENST00000591271 9678 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 EML5-201ENST00000380664 5910 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 TAF8-201ENST00000372977 6680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC012313.8-201ENST00000595059 5402 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 KIF13A-213ENST00000636847 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 CACNA1E-206ENST00000367573 7067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 BAZ2A-211ENST00000549884 6050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 PTPRM-202ENST00000400053 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 POGZ-201ENST00000271715 6626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 PCDH12-201ENST00000231484 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 HMGB4-204ENST00000522796 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PKHD1P08F94 DPY19L1-201ENST00000310974 4870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms