Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
ERVV-2B6SEH9 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms