Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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USP18Q9UMW8 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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USP18Q9UMW8 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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USP18Q9UMW8 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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USP18Q9UMW8 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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USP18Q9UMW8 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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USP18Q9UMW8 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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