Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 POT1-201ENST00000357628 4080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 ZNF845-202ENST00000595091 4413 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 NUP214-203ENST00000451030 5021 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 CABIN1-214ENST00000617531 7072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 COL4A6-210ENST00000621266 6627 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 SUPT6H-202ENST00000347486 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 CCSER1-209ENST00000509176 5847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 ROBO2-202ENST00000461745 8946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 PRPF8-201ENST00000304992 7295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 BTBD3-214ENST00000618296 4582 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 AGPAT4-203ENST00000366911 7705 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 KIZ-AS1-203ENST00000616177 5370 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 LGALS8-212ENST00000450372 6281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 PTPRD-204ENST00000397606 5038 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 PTPRD-211ENST00000486161 5039 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 KIF13A-204ENST00000378826 5747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 MTOR-201ENST00000361445 8677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 GLRA2-201ENST00000218075 3216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 ZNF175-201ENST00000262259 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 DROSHA-202ENST00000442743 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 AC105046.1-201ENST00000566457 4997 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 PPIP5K1-203ENST00000360135 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 PPIP5K1-204ENST00000360301 5565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
LYSTQ99698 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms